Penerimaan calon mahasiswa baru IAIN Syekh Nurjati Cirebon untuk program sarjana (S-1) hanya dilakukan setiap tahun akademik baru. Jalur penerimaan calon mahasiswa baru untuk program sarjana (S-1) adalah sebagai berikut :
- Jalur Seleksi Prestasi Akademik Nasional Perguruan Tinggi Keagamaan Islam Negeri (SPAN-PTKIN). Jalur ini merupakan jalur penelusuran prestasi calon mahasiswa semasa di MA/SMA baik negeri maupun swasta dengan kriteria yang ditentukan secara nasional. Pendaftaran dilakukan secara kolektif dan online melalui website https://span-ptkin.ac.id/page oleh madrasah/sekolah masing-masing. Penentuan kelulusan jalur ini dilakukan serentak secara nasional.
- Jalur Ujian Masuk Perguruan Tinggi Keagamaan Islam Negeri (UM-PTKIN). Jalur ini dilakukan melalui ujian tulis secara nasional. Peserta dapat mengikuti ujian tulis di UIN/IAIN/STAIN maupun di seluruh indonesia. Penentuan kelulusan jalur ini dilakukan secara nasional. Informasi UM-PTKIN meliputi ketentuan dan persyaratan umum, tatacara pembayaran biaya seleksi, tata cara pendaftaran, jadwal pelaksanaan, serta jumlah pilihan PTKIN dan Progam Studi dapat diakses melalui laman https://um-ptkin.ac.id/
- Jalur Seleksi Penerimaan Mahasiswa Baru (Mandiri). Penerimaan melalui jalur ini dilakukan dengan ujian tulis dan ujian lisan oleh IAIN Syekh Nurjati Cirebon secara mandiri. Pendaftaran dilakukan secara online melalui website http://sc.syekhnurjati.ac.id/spmb/index.php.
